set mesurement 1  -1  5  -1  0.1  0.5

Distanzen: measure delete;measure (2:B.P) (12:B.P);measure (2:B.P) (6:A.P);measure (6:A.P) (12:B.P);measure (12:B.P) (2:A.P);
measure delete; measure (2:A) (12:B);
measure delete; measure all (2:A) (12:B);
measure delete; measure (*:A.P) (*:B.P)
measure delete; measure all (*:A.P) (*:B.P);
measure delete; measure range 1.0 3.2 all (*:A) (*:B);

Winkel: measure delete; measure (5:A.P) (6:A.P) (7:A.P);

Torsionswinkel: measure delete; measure (5:A.P) (6:A.P) (7:A.P) (8:A.P);

Befehl "measure" oder "monitor"

measure [ on | off ]; {default: on}
set showMeasurements [ on | off ]; Blendet die Messresultate ein oder aus.

measure (1.Atom) (2.Atom); misst die Distanz zwischen den zwei Atomen
measure (1.Atom) (2.Atom) (3.Atom); misst den Winkel zwischen den zwei Geraden, die durch die Atompositionen 1 und 2 resp. 2 und 3 definiert werden.
measure (1.Atom) (2.Atom) (3.Atom) (4.Atom); misst den Diheder-Winkel (Torsionswinkel), also den Winkel zwischen den zwei Ebenen, die durch Atompositionen 1, 2 und 3 und durch Atompositionen 2, 3 und 4 definiert werden

(1.Atom), (2.Atom), (3.Atom), (4.Atom) sind Atom-Auswahlen. Spezifizieren diese mehr als ein Atom, so wird das erste Atom in der Liste benutzt. Mit

measure all (1.Atom) (2.Atom);
measure all (1.Atom) (2.Atom) (3.Atom);
measure all (1.Atom) (2.Atom) (3.Atom) (4.Atom);

werden alle Atome in der Auswahlliste benutzt. Mit

measure allconnected ...;

werden alle Atome benutzt, die mit den spezifizierten Atomen kovalent verküpft sind

measure delete ...;

löscht die entsprechenden Atome aus der Auswahliste der zu messenden Distanzen, Winkel oder Diheder-Winkel, ohne Parameter löscht es alle vorghergehenden Messungen.

measure range [Grenzwert dezimal] [Grenzwert dezimal] [ all | allconnected | delete ] ...;

schränkt die Auswahl ein auf diejenigen Werte, die innerhalb der Grenzwerte liegen.

set measurement [Dezimalbruch, <2.0]; Breite in Angström
set measurement [ Integer]; Linienstärke in Pixel
set measurement -1; gepünktelte Line
set measurementUnits [angstroms | nm | nanometers | pm | picometers | bohr]; Einheit der Distanzangabe