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Messen von Distanzen und Winkeln

Interatomare Distanzen, Winkel und Torsionawinkel lassen sich leicht bestimmen


set measurementsUnits:

set mesurement

Distanzen:

Winkel:

Torsionswinkel:

Befehl "measure" oder "monitor"

measure [ on | off ]; {default: on}
set showMeasurements [ on | off ]; Blendet die Messresultate ein oder aus.

measure (1.Atom) (2.Atom); misst die Distanz zwischen den zwei Atomen
measure (1.Atom) (2.Atom) (3.Atom); misst den Winkel zwischen den zwei Geraden, die durch die Atompositionen 1 und 2 resp. 2 und 3 definiert werden.
measure (1.Atom) (2.Atom) (3.Atom) (4.Atom); misst den Diheder-Winkel (Torsionswinkel), also den Winkel zwischen den zwei Ebenen, die durch Atompositionen 1, 2 und 3 und durch Atompositionen 2, 3 und 4 definiert werden

(1.Atom), (2.Atom), (3.Atom), (4.Atom) sind Atom-Auswahlen. Spezifizieren diese mehr als ein Atom, so wird das erste Atom in der Liste benutzt. Mit

measure all (1.Atom) (2.Atom);
measure all (1.Atom) (2.Atom) (3.Atom);
measure all (1.Atom) (2.Atom) (3.Atom) (4.Atom);

werden alle Atome in der Auswahlliste benutzt. Mit

measure allconnected ...;

werden alle Atome benutzt, die mit den spezifizierten Atomen kovalent verküpft sind

measure delete ...;

löscht die entsprechenden Atome aus der Auswahliste der zu messenden Distanzen, Winkel oder Diheder-Winkel, ohne Parameter löscht es alle vorghergehenden Messungen.

measure range [Grenzwert dezimal] [Grenzwert dezimal] [ all | allconnected | delete ] ...;

schränkt die Auswahl ein auf diejenigen Werte, die innerhalb der Grenzwerte liegen.

set measurement [Dezimalbruch, <2.0]; Breite in Angström
set measurement [ Integer]; Linienstärke in Pixel
set measurement -1; gepünktelte Line
set measurementUnits [angstroms | nm | nanometers | pm | picometers | bohr]; Einheit der Distanzangabe

Jmol Interactive Scripting Documentation
Last changed by: A.Honegger, 9/4/08