Normalerweise ist eine Zweitasten-Maus standardmässig so konfiguriert, ein Klick auf die rechte Maustaste einem Mausklick bei gedrückter "Cntl"-Taste entspricht. Ein Klick auf die mittlere Maustaste einer Dreitasten-Maus entspricht normalerweise einem Mausklick bei gedrückter "Shift"-Taste. Da dies jedoch durch den Benutzer konfigurierbar ist, gebe ich die Kombinationen für eine Eintasten-Maus, resp. die Benutzung der linken Maustaste an.

Gehen Sie mit dem Mauszeiger in das Molekülfenster und bewegen Sie die Maus bei gedrückter (linker) Maustaste:
--> Das Molekül rotiert um die vertikale (Y-Achse)) oder horizontale Achse (X-Achse) des Bildschirms, abhängig von der Richtung der Mausbewegung

Drücken Sie gleichzeitig noch die "Shift"-Taste:
--> Das Molekül rotiert um eine Achse senkrecht zur Bildschirmebene (Z-Achse), oder die Darstellungsgrösse ändert sich (Zoom), abhängig von der Richtung der Mausbewegung.

"Shift", Doppelklick auf ein Atom des Moleküls und Mausbewegung bei gedrückter (linker) Maustaste
--> Das Molekül wird verschoben

"Shift" und Doppelklick ins Molekülfenster ausserhalb des Moleküls:
--> das Molekül springt in die Ursprungsposition zurück

Mauszeiger über einem Atom positionieren und dort belassen ohne zu klicken:
--> Die Identität des Atoms wird angezeigt

Doppelklick auf ein Atom und Doppelklick auf ein zweites Atom:
--> Die Distanz zwischen den beiden Atomen wird angezeigt

Doppelklick auf ein Atom, einzelner Klick auf ein zweites und Doppelklick auf ein drittes Atom:
--> Der Winkel, der durch die drei Punkte definiert ist, wird angezeigt

Doppelklick auf ein Atom, Klick auf ein zweites und ein drittes, Doppelklick auf ein viertes Atom:
--> Der durch die vier Punkte definierte Torsionswinkel wird angezeigt

Klick auf das "Jmol" in der linken unteren Ecke oder "Cntl" und Klick oder Klick mit der echten Maustaste
-> Das Kontext-Menü öffnet sich