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Laktat-Dehydrogenase

Substratbindungsstelle hervorheben: cyan: Aminosäurereste, die vor allem an der NADH/NAD+-Bindung beteiligt sind, gelb, Reste, die vor allem mit Laktat/Pyruvat Kontakt haben

Auf Substratbindungsstelle einzoomen

Substratanalog Oxamat als Kalottenmodell / Bindungsmodell

Oxamat hat anstelle der CH3-Gruppe von Pyruvat eine Amid-CH2-gruppe und kann deshalb nicht durch die Laktat-Dehydrogenase reduziert werden.

Cosubstrat NAD⁺ als Kalottenmodell / Bindungsmodell

Protein als Kalottenmodell / Kettenverlauf

Hydrophobizität

Ladungen

• Laden sie die Animation der Konformationsänderung,
  heben Sie die Substratbindungsstelle hervor und
  stellen Sie das Protein als Kalottenmodell dar. Wie hängt die Konformationsänderung wohl mit der enzymatischen Reaktion zusammen?
• Weshalb wurde die Struktur der geschlossenen Form der LDH mit Oxamat und nicht mit Pyruvat im aktiven Zentrum bestimme?

Molekülauswahl:

Last changed by: A.Honegger, 9/6/08