Leichte Ketten: Rosa und Magenta
Schwere Ketten: Cyan und Blau
Disulfidbrücken: Gelb

VL: Magenta
CL: Rosa
VH: Blau
CH: Cyan
Hinge: Blaugrün
CH2: Grün
CH3: Gelbgrün
Zuckerreste: Weiss, in Kugeldarstellung

Rot: Starker Kontakt, >80% Reduktion der Lösungsmittelzugänglichen Oberfläche bei Komplexbildung
Rotorange: 60-80% Reduktion
Orange: 40-60% Reduktion
Gelborange: 20-40% Reduktion
Gelb: <20%Reduktion
Weiss: Kein Kontakt

no direct CH2/CH2 protein-protein contacts