"spin" definiert die kontinuierliche Rotationsbewegung der Moleküldarstellung
spin [ on | off ]; schaltet die Molekülrotation ein und aus.
set spin FPS [frames-per-second]; definiert, wie häufig die Molekülorientierung neu berechnet wird.
set spin [ x | y | z ] [degrees-per-second]; definiert, wie schnell das Molekül um die X-Achse (vertikal), die Y-Achse (horizontal) oder die Z-Achse (senkrecht zur Bildschirmebene) rotieren soll.

siehe auch "set picking center;", " set picking spin [frames-per-second];"

Der Befehl "center" or "centre" definiert das Rotationszentrum. Als Default ist das Rotationszentrum durch den Mittelpunkt der Boundary-Box des geladenen Moleküls definiert.

center [atomauswahl]; Zentriert die Rotation auf den Mittelpunkt der ausgewählten Atome.
center [x y z]; Erlaubt, die Koordinaten des gewünschten Mittelpunkts im Referenzsystem des geladenen Moleküls anzugeben.
center [drawn-objekt]; Erlaubt, als Mittelpunkt ein gezeichnetes Objekt anzugeben

centerAt absolute x y z; Absolute Koordinaten
centerAt average x y z; Offset vom nicht gewichteten Mittel der Molekülkoordinaten
centerAt boundbox x y z; Offset relativ zum Mittelpunkt der Boundary Box

zoom [ on | off ];
zoom [ percent-default-size ]; Integer, erlaubt es, die Grösse der Molküldarstellung von 5% bis 5000% der Default-Grösse zu variieren.

translate [ x | y | z] [percent-of-windowsize]; verschiebt das Molekül entlang der spezifizierten Achse.

rotate [ x | y | z] [angle-in-degrees]; rotiert das Molekül um den spezifizierten Winkel um die x-, die y- oder die z-Achse.
rotate axisangle [ x y z] [angle-in-degrees]; rotiert das Molekül um eine Achse, die durch den Nullpunkt und die Koordinaten (x,y,z) definiert ist

reset; macht sämtliche Rotationen, Translationen und Zoom-Befehle rückgängig, das Molekül erscheint in der Ursprungs-Orientierung, -Position und -Grösse.

Mit "show center", "show orientation", "show transform" und "show zoom" kann man die aktuelle Molekültransformation abfragen.