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Kontextmenü: Auswahl
Viele Befehle, vor allem Darstellung und Anfärbung, werden nur auf den Teil des Moleküls angewandt, der gerade ausgewählt ist. So ist es möglich, auf verschiedene Teile des Moleküls unterschiedliche Darstellungoptionen anzuwenden.
"Nur Auswahl anzeigen" blendet die nicht ausgewählten Molekülteile aus.
"Selection Halos" hebt die angewählten Molekülteile/Atome hervor.
Der Vorgang des Auswählens ändert die Darstellung nicht, es sei denn, "Nur Auswahl anzeigen" oder "Selection Halos" ist eingeschaltet, sie bestimmt nur, auf welche Atome nachfolgende Befehle angewandt werden.
"Alle(s)" wählt alle Atome aus, "Nichts" entfernt alle Atome aus der Auswahlliste, und "Auswahl invertieren" kehrt die Auswahl um, so dass nun nur alle vorher nicht gewählten Atome in der Auswahlliste sind.
"Element" erlaubt, die Atome eines bestimmten im Molekül enthaltenen Elementes auszuwählen, nur die wirklich vorhandenen Elemente werden angezeigt.
"Symmetrie" erlaubt es, durch kristallographische Symmetrieoperationen erzeugte Kopien eines Moleküls einzeln auszuwählen, wenn welche vorhanden sind.
"Protein" enthält proteinspezifische Auswahlkriterien wie Auswahl nach Aminosäureresten, Hauptkette und Seitenketten, es können auch Gruppen von Resten wie polare / unpolare, saure, basische und ungeladene Reste angewählt werden
"Nucleic" enthält Nukleinsäuren-spezifische Auswahlkriterien (DNA/RNA), Basen
"Hetero" Heteroatome in PDB-Dateien sind Atome, die weder Protein noch Nukleinsäuren sind. Es können Lösungsmittelmoleküle sein (solvent), Liganden und Kofaktoren, Ionen u.s.w.
"Kohlenhydrate" Auswahl von Zuckern und Kohlehydraten, Glykosylierungen in Proteinstrukturen
"Keine der Genannten"
Schalten Sie "Selection Halos" ein und probieren Sie aus, was passiert, wenn Sie verschiedene Punkte des Auswahlmenüs anwählen!
