Innerhalb der beiden variablen Domänen des FV-Fragments zeigen die grün eingezeichneten Bereiche die höchste Sequenz- und Strukturvariabilität. Sie werden CDRs (complementarity determining regions) genannt. Die Verteilung von hydrophoben und hydrophilen, neutralen, sauren und basischen Aminosäuren-Seitenketten in diesen Bereichen führt zu einer Kontaktoberfläche, die spezifisch an eine räumlich und elektrostatisch komplementäre Oberfläche des Antigens binden kann. Die weiss und grau eingezeichneten Teile des Moleküls bilden das einheitliche Stützgerüst (framework), das diese Oberfläche trägt.